Archive for 科学工作

入手工作用的 iPad

之前用的Google Nexus 10,发现可以使用的工具不多。看了几个学术圈人写的博客,大部分人推荐的应用都只有iPad版本。主要的目的是,读和标注PDF/Word文档,文献管理,工作笔记(需要手写和草图),写作。

初衷是为了方便研究工作,结果不久就可以知道了。昨天买的几个硬件:

  1. iPad Air 64GB WiFi
  2. Smart Cover
  3. Logitech Keyboard Cover
  4. Jot Pro capacitive stylus

已经安装了的几个应用

  • Evernote
  • Penultimate
  • Note Taker HD
  • GoodReader
  • Pages / Keynote etc.

iPad上的 OmniFocus 正在犹豫。可能还会考虑的应用有:

  • Papers
  • OmniFocus
  • Awesome Notes

工作使用种,最好是有个整合的环境,文档方面都可以同同步。通过Dropbox或者Google Drive或者Evernote,都是不错的解决方案。

相比Android的应用,iPad上的好软件不少,但基本都收费。例如几个需要用的Shell和LaTeX编译环境,在Android上就非常容易获得好用又免费的。

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GnuPlot + LaTeX 整合的例子

下面写的是如何在GnuPlot输出中添加公式,然后被LaTeX使用输出的图像。

主要步骤为:
(一)写一个名为plot.plt的GnuPlot脚本,主要目的是输出一个output.tex的文件

set terminal epslatex standalone lw 2 color 11
set output 'output.tex'
set xlabel '$\mathcal{M}$'
set ylabel '$\mathcal{G}$'
set title 'Title with \LaTeX equation $x=y$'
plot "test.dat" using 1:2 title "experiments" with points pt 7
set output

(二)写一个make.sh脚本,用LaTeX编译tex文件,输出eps,然后转换成pdf。

gnuplot *.plt
pdflatex *.tex
rm *.aux
rm *.log
rm *-inc.eps
rm *-inc.pdf

然后到目录下面,直接命令行执行这个脚本文件,就可以得到需要的数据图像。

下面是个简单的输出。

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青年研究基金

昨天组里的两个博后提交了澳洲青年研究基金(DECRA)的评审回复(rejoinder)。

在项目书的准备过程,E同志写得中规中矩,我们聊起来说这个项目基本申请属于没有太多创新,“抄冷饭”的类型。D同志写得天马行空,确实是个新课题。结果评审意见也可以看出,对于E同志的支持(因为看得懂),对于D同志的忽略(因为看不懂)。E获得三个评审意见,都是正面为主。D只有两个评审,其中一个非常不负责,评审内容不超过一句话。

这个很可能澳洲研究基金的体系有关。评审人们(包括我自己)一般都是拖拉到最后一天,才看手里的七八份项目书,根本没有时间去细嚼慢咽。所以写项目书的基本要素就是,说自己很“创新”,但是写过程的时候,一定要拉底自己的“水平”。写到让“外行”们都可以读懂,但是“内行”们又挑不出什么错误。

在澳洲科研评审过程中,还有就是明显和普遍的“数数游戏”:多少文章,多少引用,影响因子如何。和国内的评审非常类似。这些数字,在德国人的评审体系里根本看不到,原因可能是,数字可能是个客观的参考,但是在项目评审过程中,没有必要去提及,而需要直接就事论事。“数数游戏”简单可行,又貌似“客观”,不用太费脑细胞。当然坏处和副作用也是显而易见的。

注:澳洲青年研究基金(DECRA)资助三年的研究工作,10%左右的成功率。资助包括项目负责人的工资。所谓“青年”,澳洲的定义不是年龄,而是博士毕业五年以内。

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年年此时

年年都是这个时候,系里的年轻人们在写项目申请,没日没夜地干一个月左右时间。还好明天是项目申请书提交的截至日期,提交以后,终于可以回到正常的工作和生活节奏里了。

因为明年手里还有两个项目,算是比较幸运,暂时不用再写这个申请了。但无法避免地想到明年这个时候,又需要去准备下一个项目,即将投入的时间和精力。澳洲ARC Discovery Project 20%的成功率,10%的资金支持率,意味着提交一个项目申请以后,大部分的可能性是不成功的。

写科研项目申请书,如果你在意的话,几乎一直都是有改进的余地,这个过程消耗了大量的时间和精力。写的目的总是期望有那么点正面的回报。倘使不成功,则意味着大部分的投入都付之东流。对于有教职的人们来说,项目申请的成功与否,意味着职业发展的快慢,成功了算是额外的奖励,失败了明年再来。而对于我们这批PostDoc来说,则意味着太多的东西...... 对于这个项目申请书,也包含着太多的复杂感受:对于研究的热爱,对于未来的期望,对于不确定性的担忧......

也有些怀疑此类的科研支持体系的合理性,浪费的精力其实可以做些更有意义的研究工作。不过,还是需要花费一定的时间去规划未来n年的研究方向,写个科研项目书就是一个类似的过程。 当然,如果真正喜欢这个研究方向的话,无论是否项目中标,都会去开展新的研究方向的。

等到申请结果出来以后(一般十个月左右),要不发现项目已经做得差不多了,要不已经不再像写的时候那个摸样了。

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在LaTeX文档里去除 Mendeley输出的URL

之前写文档也曾经遇到的问题,Mendeley自动输出的bib文档里包含了所有的信息。弄到bibtex里,除了几个特别的bibtex格式,都存在比较烦人的URL。如图:

搜索了网页,没有发现可以直接解决的方案。

这次会议论文四页,在参考文献里去除这些多余的信息,每次都需要手动修改bbl文件。下面是个想到的折中方法,就是直接用vim修改bib文档。

  1. 复制Mendeley自动备份的bib文档,到工作目录。
  2. 用vim删除含有url关键词的行,于是有个新的bib文档
  3. 用bibtex编译,在生成的文档里没有了url。
  4. 同样的方法可以去除issn, arXiv, doi等等。

vim里的命令为

:g/url/d

:g/issn/d

:g/arXiv/d

意义为搜素文档,删除含有关键词(url, issn, arXiv)的行。

搞定。

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